北京地区
数学与系统科学研究院          http://www.amss.ac.cn/
力学研究所                              http://www.imech.ac.cn/
物理研究所                              http://www.iphy.ac.cn/
高能物理研究所                      http://www.ihep.ac.cn/
声学研究所                              http://www.ioa.ac.cn/
理论物理研究所                      http://www.itp.ac.cn/
国家天文台                              http://www.bao.ac.cn/
自然科学史研究所                  http://www.ihns.ac.cn/
理化技术研究所                      http://www.ipc.ac.cn/
化学研究所                              http://www.icas.ac.cn/
过程工程研究所                     http://www.ipe.ac.cn/ipe2005/index.php
生态环境研究中心                  http://www.rcees.ac.cn/
古脊椎动物与古人类研究所  http://www.ilpp.ac.cn/
大气物理研究所                      http://www.iap.ac.cn/
地理科学与资源研究所          http://www.igsnrr.ac.cn/
遥感应用研究所                     http://www.page.irsa.ac.cn/
空间科学与应用研究中心    http://www.cssar.ac.cn/
遥感卫星地面站                    http://www.rsgs.ac.cn/
地质与地球物理研究所        http://www.igcas.ac.cn/
动物研究所                           http://www.ioz.ac.cn/
植物研究所                           http://www.ibcas.ac.cn/
生物物理研究所                   http://www.ibp.ac.cn/
微生物研究所                       http://www.im.ac.cn/
遗传与发育生物学研究所   http://www.genetics.ac.cn/
心理研究所                           http://www.psych.ac.cn/
计算技术研究所                   http://www.ict.ac.cn/
工程热物理研究所               http://www.etp.ac.cn/
半导体研究所                       http://www.semi.ac.cn/
电子学研究所                       http://www.ie.ac.cn/
自动化研究所                       http://www.ia.ac.cn/
电工研究所                           http://www.iee.ac.cn/
软件研究所                           http://www.ios.ac.cn/
北京科学仪器研制中心        http://www.kyky.com.cn/
文献情报中心                       http://www.las.ac.cn/
微电子中心                           http://www.ue.ac.cn/
计算机网络信息中心            http://www.cnic.ac.cn/
科技政策与管理科学研究所 http://www.casipm.ac.cn/

上海地区
上海原子核研究所 http://www.sinr.ac.cn/
上海天文台 center.shao.ac.cn
声学研究所东海研究站 www.ioa.ac.cn/zuzhi/0808dongzhan/
上海有机化学研究所 http://www.sioc.ac.cn/
上海硅酸盐研究所 http://www.sic.ac.cn/
上海分院 http://www.cst.sh.cn/
上海生命科学研究院 http://www.sibs.ac.cn/
上海药物研究所 http://www.simm.ac.cn/
上海微系统与信息技术研究所 http://www.sim.ac.cn/
上海光学精密机械研究所 http://www.siom.ac.cn/
上海技术物理研究所 http://www.sitp.ac.cn/

南京地区

紫金山天文台 http://www.pmo.ac.cn/
南京地质古生物研究所 http://www.nigpas.ac.cn/
南京地理与湖泊研究所 http://www.niglas.ac.cn/
南京分院 http://www.njbas.ac.cn/
南京土壤研究所 http://www.issas.ac.cn/
南京天文仪器研制中心 http://www.nairc.ac.cn

长春

长春应用化学研究所 http://www.ciac.jl.cn/
东北地理与农业生态研究所 http://www.neigae.ac.cn/
长春分院 http://www.ccb.ac.cn/
长春光学精密机械与物理研究所 [url]http://www.ciom.ac.cn

合肥

等离子体物理研究所 http://www.ipp.ac.cn/
固体物理研究所 http://www.issp.ac.cn/
合肥分院 http://www.hfcas.ac.cn/
安徽光学精密机械研究所 http://www.aiofm.ac.cn/
合肥智能机械研究所http://www.iim.ac.cn

武汉

武汉岩土力学研究所 http://www.whrsm.ac.cn/
武汉物理与数学研究所 http://www.wipm.ac.cn/
测量与地球物理研究所 http://www.whigg.ac.cn/
武汉分院 http://www.whb.ac.cn/
武汉植物研究所 http://www.whiob.ac.cn/
水生生物研究所 http://www.ihb.ac.cn/
武汉病毒研究所 http://www.whiov.ac.cn

广州

广州化学研究所 http://www.gic.ac.cn/
南海海洋研究所 http://www.gzb.ac.cn/
广州分院 http://www.gzb.ac.cn/
华南植物研究所 http://www.scib.ac.cn/
广州能源研究所 http://www.giec.ac.cn/
广州地球化学研究所 http://www.gig.ac.cn/
亚热带农业生态研究所 http://www.isa.ac.cn/[/url]
中国科学院广州生物医药与健康研究院http://www.gibh.ac.cn

昆明

云南天文台 http://www.cosmos.ynao.ac.cn/
昆明分院 http://www.kmb.ac.cn/
昆明动物研究所 http://www.kiz.ac.cn/
昆明植物研究所 http://www.kib.ac.cn/
西双版纳热带植物园 http://www.xtbg.ac.cn

成都

成都山地灾害与环境研究所 http://www.imde.ac.cn/
成都分院 http://www.cdb.ac.cn/
成都生物研究所 http://www.cib.ac.cn/
光电技术研究所 http://www.ioe.ac.cn/
四川中科院信息技术有限公司 http://www.casit.ac.cn

西安

国家授时中心 http://www.sxso.ac.cn/
西安分院 http://www.xab.ac.cn/
水土保持与生态环境研究中心 http://www.iswc.ac.cn/
西安光学精密机械研究所 http://www.opt.ac.cn/
地球环境研究所  http://www.llqg.ac.cn